目前進口台灣並通過查驗登記許可的基改作物一共有5種，分別是：黃豆、玉米、棉花、油菜及甜菜根。衛福部以往規定，「國際上已審核通過可種植或作為食品原料使用的基因改造食品原料」得以自主標示「非基改」等字樣，近期新草案則將範圍規定限於「經國內查驗登記核准於食品使用的基因改造原料」，也就是目前台灣查驗核准的黃豆、玉米、棉花、油菜及甜菜根等五類基改作物，未來業者若在此5種品項外的產品標示「非基因改造」或「不是基因改造」等字樣，衛福部除將依食安法第52條規定，通知限期回收改正，更可對違規業者開罰4萬至400萬元不等的罰鍰。