食物相剋其實就是一種食物拮抗作用，前面所說的食物相剋現象，再從各種食物所含不同化學性狀分析，其實就是食物拮抗作用的緣故，而引起食物拮抗作用的原理不外乎以下三種情況：（1）化學締合 使食物中的某些營養素形成不易被機體吸收的物質，如植酸與磷、鋅、銅、鐵等形成金屬締合物；脂肪與鈣作用產生不溶性鈣皂等。（2）相互作用物爭奪配位體 食物在體內代謝過程中同屬一個轉移系統的礦物元素，由於彼此爭奪配位體，以及它們與配位體的親和力不同，就會發生拮抗作用。即進入體內的某一種元素特多時，將使另一種元素從同種配位體的結合點上被排斥出去，同時阻礙了被排斥元素的吸收。（3）腸道外因素 如高蛋白抑制銅在肝中的貯積；高濃度無機硫酸鹽能阻止鉬透過腎小管膜，限制了鉬的再吸收，因而增加了尿鉬的排出。食物的拮抗作用在消化吸收與代謝過程中，將會降低食物中營養物質的吸收利用率，久而久之導致體內某些營養素的缺乏，產生相應的營養缺乏症，繼而影響到機體的正常功能及其新陳代謝。